《米小圈學校》三年級第二季以「鐵三角」為主角，頑皮乖巧、聰明又勇敢的孩子們在校園裡一起學習、生活、成長。故事分為校園生活和家庭兩個場景。在溫馨充滿愛的家庭裡，米小圈和父親總是能製造出讓米母難堪的事；在色彩繽紛的校園裡，米小圈和他的同學將學習到大量的科學知識，並參與校內外的各種活動。各種有趣的活動，共同解決難題和煩惱，最後成為更好的人。