科學王國聚焦石化之光之源，世界背景，全新世界！離開人間，解開石化之謎！石界的大發現時代已經開啟——?，最強高中生獅子王子率領的“帝國帝國”步步為營。該部門決心淨化人類，試圖通過使用超級大國來阻止科學進步。科學對戰武力激戰之後，赤庫等人的科學帝國占據了上風，最終的目標是用科學的力量來恢復整個世界。然而，幾千年過去了，一眨眼的功夫，所有人都被一個奇異的現象嚇了一跳——擁有超人智慧的自然科學少年千空甦醒了。在文明被毀滅的石頭世界中，千空集結了新盟友的力量，建立了“科學帝國”，兩國再次和解。因朋友的陰謀而處於冰冷狀態的斯，為了喚醒全人類。